Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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