Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms