Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ttc21bQ0HA38 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ttc21bQ0HA38 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ttc21bQ0HA38 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ttc21bQ0HA38 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms