Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms