Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms