Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms