Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cldn12-203ENSMUST00000115446 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Anapc15-205ENSMUST00000106978 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm6723-201ENSMUST00000180449 441 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm45824-201ENSMUST00000212236 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm5173-201ENSMUST00000219616 950 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm8153-201ENSMUST00000219844 952 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm6187-201ENSMUST00000040649 960 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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PdgfaP20033 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PdgfaP20033 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PdgfaP20033 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PdgfaP20033 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms