Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm8356J3QPD3 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms