Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
XntrpcF8VQM8 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms