Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Col4a6B1AVK5 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Col4a6B1AVK5 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Col4a6B1AVK5 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Col4a6B1AVK5 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Col4a6B1AVK5 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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