Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Prr14-202ENSMUST00000106292 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 9130214F15Rik-201ENSMUST00000208727 1653 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm26628-201ENSMUST00000181028 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hdac5Q9Z2V6 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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