Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930474B08Rik-201ENSMUST00000194161 837 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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