Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm9531-202ENSMUST00000183511 775 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Clrn2-201ENSMUST00000053250 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm12002-202ENSMUST00000153794 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Fabp12-201ENSMUST00000029043 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Nutm2-201ENSMUST00000096633 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms