Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifi35Q9D8C4 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms