Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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