Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms