Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NischQ80TM9 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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