Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms