Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 BC049715-202ENSMUST00000163640 744 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8689-201ENSMUST00000218709 712 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms