Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp19Q3UJD6 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms