Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms