Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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