Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Siah1bQ06985 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms