Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms