Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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P10404 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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P10404 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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P10404 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
P10404 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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