Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms