Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms