Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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