Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms