Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms