Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms