Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms