Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox12-201ENSMUST00000096453 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc12-201ENSMUST00000048067 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp9-201ENSMUST00000060917 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp9-202ENSMUST00000074465 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl10-201ENSMUST00000001599 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Magea2-201ENSMUST00000069477 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44992-210ENSMUST00000210126 1330 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52-ps-201ENSMUST00000178097 523 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 1700019D03Rik-204ENSMUST00000186266 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8850-201ENSMUST00000195316 588 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5183-201ENSMUST00000219409 629 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 AC165159.2-201ENSMUST00000224080 441 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rps12-201ENSMUST00000073926 490 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tert-201ENSMUST00000022104 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Igbp1-201ENSMUST00000033570 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Lnpk-202ENSMUST00000102676 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc2-201ENSMUST00000035076 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Nell2-201ENSMUST00000075275 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem209-201ENSMUST00000064330 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b7-201ENSMUST00000027989 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Pnp-201ENSMUST00000178092 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms