Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms