Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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