Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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NcstnP57716 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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