Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms