Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VhlP40338 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
VhlP40338 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VhlP40338 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
VhlP40338 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms