Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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