Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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