Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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