Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RhoP15409 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms