Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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