Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms