Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Samt1A2BED8 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms