Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc47Q9D024 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc47Q9D024 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
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