Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms