Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms