Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Shq1Q7TMX5 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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Shq1Q7TMX5 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Shq1Q7TMX5 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Shq1Q7TMX5 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Shq1Q7TMX5 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Shq1Q7TMX5 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Shq1Q7TMX5 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Shq1Q7TMX5 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Shq1Q7TMX5 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Shq1Q7TMX5 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Shq1Q7TMX5 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Shq1Q7TMX5 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Shq1Q7TMX5 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Shq1Q7TMX5 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Shq1Q7TMX5 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Shq1Q7TMX5 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Shq1Q7TMX5 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Shq1Q7TMX5 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Shq1Q7TMX5 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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