Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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